DST institute develops new multiplex RT-PCR kit with novel gene targets to facilitate detection across various mutant strains of COVID 19

18-05-2021 Tue 17:45

  • This unique RT-PCR kit will be a significant weapon in our fight against COVID-19 by a facile detection of SARS-CoV-2 mutations: Secretary, DST, Prof Ashutosh Sharma
A newly developed multiplex RT-PCR kit has a higher accuracy of detecting covid19 across the various mutant strains of the virus responsible for the global pandemic.

As the pandemic is going through a second wave with multiple variants, the selection of target genes in multiplex RT-PCR assay is becoming critical for accurate detection of the virus.

Even though coronaviruses make far fewer errors than other RNA viruses, the mutations in S, R, and N genes often interfere with RT-PCR assay.  For example, the “variant of concern” B1.1.7 (also known as the UK variant) has a 69-70del, due to deletion of 6 bases in the RNA, which resulted in S gene drop out from RT-PCR assay.

The new multiplex RT-PCR kit developed Sree Chitra Tirunal Institute for Medical Sciences and Technology (SCTIMST), an Institute of National Importance under the Department of Science and Technology, Government of India targets two SARS CoV2 genes: RdRp and ORFb-nsp14, and the human RNAse P gene as the internal control to help detect a range of mutant strains.

Various studies have shown that RdRp and ORF1b-nsp14 genes are more sensitive in detecting Covid19. In order to target the multiple variants in the second wave, using two highly accurate confirmatory genes like RdRp and ORF-nsp14, can give precise results. The ORFb-nsp14 is one of the least mutated genes in Covid19 and currently, there are no kits in the market with ORF-nsp14 as the target.

The new kit is based on multiplex Taqman chemistry, amplifying all three genes in a single reaction. The amplification time for the assay is 45 minutes, apart from the time required for the RNA isolation from nasopharyngeal swab samples. Multiplexing two confirmatory genes will help shortlist possible new variants if one of the genes fails to amplify and can be marked for sequence analysis.

ICMR has validated this kit at the National Institute of Virology, Pune, and found that it has 97.3% sensitivity and 100% specificity in covid19 detection.

SCTIMST has signed a non-exclusive license MoU with Huwel Lifesciences, Hyderabad, on 14th May 2021 to commercialize the kit.

“This unique RT-PCR kit will be a significant weapon in our fight against COVID-19 by a facile detection of SARS-CoV-2 mutations which are becoming increasingly important,” said Secretary, DST, Prof Ashutosh Sharma.


More Press Releases
Cable Television Network Rules amended
7 hours ago
Cabinet Sub-Committee to study on functioning of Hospitals holds the first meeting
8 hours ago
ధాన్యం దిగుబడి, కొనుగోళ్లలో సరికొత్త చరిత్ర: తెలంగాణ పౌరసరఫరాల సంస్థ ఛైర్మన్
8 hours ago
WayCool launches 2nd Shuddha Dairy Square in Tirupati
11 hours ago
Battlegrounds Mobile India early access is now live on Google Play Store for players in India
12 hours ago
IKEA enters Bengaluru with eCommerce and Mobile Shopping App
12 hours ago
Quaker Provides Oatmeals to healthcare professionals at Osmania General Hospital
14 hours ago
Telangana Covid Vaccination update as on 16.06.2021 at 09 PM
19 hours ago
Hamsini Entertainment Brings Thaman To The USA
1 day ago
PM delivers Keynote address at the 5th edition of VivaTech
1 day ago
I-Tech, a new startup forays into the K-12 segment
1 day ago
Sajan Raj Kurup launches Saintfarm, a new end-to-end e-Commerce Venture in Organic and Sustainable food
1 day ago
New Range Rover Velar introduced in India
1 day ago
NHAI makes drone survey mandatory for all NH projects
1 day ago
Flipkart opens one of its largest warehouses in West Bengal
1 day ago
Telangana Covid Vaccination update as on 15.06.2021 at 09 PM
1 day ago
Jio launches 'JioFiber postpaid'
2 days ago
Telangana Covid Vaccination update as on 14.06.2021 at 09 PM
2 days ago
CS Somesh Kumar holds a review meeting with officials on growing of Oil Palm
2 days ago
టోక్యో ఒలంపిక్స్ కు ఎంపికైన తెలంగాణ క్రీడాకారుడు.. ఘనంగా సన్మానించిన మంత్రి శ్రీనివాస్ గౌడ్
2 days ago
Jaguar land rover to develop hydrogen powered defender fuel cell prototype
2 days ago
Hero MotoCorp announces the fourth edition of Hero colabs
2 days ago
Chingari announces ‘Chingari World Music Day Concert’
2 days ago
Godrej and Boyce launches Mobile calibrations service van in Telangana and AP
2 days ago
Innoviti launches G.E.N.I.E, India’s first smart marketing app for local mobile retailers
2 days ago
Advertisement
Video News
Mamata challenges Suvendhus Victory in nandigram
సువేందు అధికారి గెలుపును హైకోర్టులో సవాల్‌ చేసిన మమతా బెనర్జీ!
6 hours ago
Advertisement 36
Rs 21 cr Gold has been seized
రూ.21 కోట్లు విలువ చేసే బంగారం పట్టివేత.. వెలికితీయడానికి 18 గంటలు
6 hours ago
Congress replies on BJP remarks on Rahul vaccination
సోనియా వ్యాక్సిన్ తీసుకున్నారు... రాహుల్ కు మరికొంత సమయం పడుతుంది: కాంగ్రెస్
6 hours ago
AP High Court orders to cancel Mega Solar Power Project Tender
మెగా సోలార్ పవర్ ప్రాజెక్టు టెండర్ రద్దు చేయాలని ఏపీ హైకోర్టు ఆదేశాలు
7 hours ago
Students arrested in delhi Riots case released today
ఢిల్లీ అల్లర్ల కేసులో అరెస్టయిన విద్యార్థుల విడుదల
7 hours ago
YSRCP will be in leading position in AP Legislative Council
రేపటితో ముగియనున్న ఏడుగురు టీడీపీ ఎమ్మెల్సీల పదవీకాలం... మండలిలో పెరగనున్న వైసీపీ బలం
7 hours ago
TRS MP BB Patil clarifies on rumors
నేను బీజేపీలో చేరుతున్నట్టు దుష్ప్రచారం చేస్తున్నారు: టీఆర్ఎస్ ఎంపీ బీబీ పాటిల్
7 hours ago
Vehicle documents will be Valid till sept 30
వాహన పత్రాల గడువు తీరిందా.. ఏం ఫరవాలేదు!
7 hours ago
Tamilnadu CM MK Stalin met PM Modi in Delhi
నీట్, నూతన విద్యావిధానం రద్దు చేయాలని ప్రధానిని కోరాను: తమిళనాడు సీఎం స్టాలిన్
8 hours ago
Domestic air travel has been down in may
మే నెలలో గణనీయంగా పడిపోయిన దేశీయ విమాన ప్రయాణాలు
8 hours ago
Team India announced for WTC Final against New Zealand
డబ్ల్యూటీసీ ఫైనల్ మ్యాచ్ కు టీమిండియా ఎంపిక
8 hours ago
serum is going to start Novavax clinical trials in children by july
పిల్లలపై నొవావాక్స్ కరోనా టీకా క్లినికల్‌ ట్రయల్స్‌: సీరం
8 hours ago
Third wave may nor affect children sevrerly says AIIMS WHO Survey
థర్డ్‌ వేవ్‌ ప్రభావం పిల్లలపై అధికంగా ఉండకపోవచ్చు: ఎయిమ్స్‌-డబ్ల్యూహెచ్‌ఓ అధ్యయనం
9 hours ago
Dip in Telangana corona new cases
తెలంగాణలో కొత్తగా 1,492 కరోనా కేసులు, 13 మరణాలు
9 hours ago
Eatala prepares for Huzurabad by election
ప్రజలు కేవలం ప్రేమకు మాత్రమే లొంగుతారు: ఈటల
9 hours ago
JaiRam Ramesh wants party leadership to be in order
మా పార్టీ నాయకత్వాన్ని క్రమబద్ధీకరించాల్సి ఉంది: జైరాం రమేశ్‌
9 hours ago
All set for WTC Summit Clash between India and New Zealand
భారత్ వర్సెస్ న్యూజిలాండ్... డబ్ల్యూటీసీ ఫైనల్ కు సర్వం సిద్ధం
9 hours ago
KTR writes letter to Nirmala Sitharaman
నిర్మలా సీతారామన్ కు లేఖ రాసిన కేటీఆర్
9 hours ago
Vijayasai Reddy confidants Visakha as state executive capital
విశాఖ కేంద్రంగా ఎగ్జిక్యూటివ్ క్యాపిటల్ ఖాయం: విజయసాయిరెడ్డి
10 hours ago
rafale nadal announced that he is not going to participate n wimbledon and Olympics
టెన్నిస్‌ దిగ్గజం రఫెల్‌ నాదల్‌ అనూహ్య నిర్ణయం!
10 hours ago